Introducción. La infección neonatal es una de las patologías que más preocupación causa a padres y personal que participa en su atención, con una alta letalidad, sobre todo, en neonatos pretérminos. Los microorganismos causantes de infecciones neonatales han variado en el tiempo cobrando gran relevancia la presencia de los virus. Objetivo. Realizar el diagnóstico etiológico de las infecciones neonatales haciendo énfasis en las infecciones virales. Tipo de estudio: Se realiza un estudio retrospectivo, transversal, analítico en el Hospital Ginecobstétrico Docente. Materno Norte "Tamara Bunke Bíder" de Santiago de Cuba, durante el periodo comprendido desde el 1ro de enero al 31 de diciembre de 2012. Universo: La muestra estuvo conformada por un total de 69 neonatos con diagnóstico de infección. Material y método: A todos los pacientes se les realizaron estudios bacteriológicos y en los casos donde se sospechó infección viral se tomaron muestras que se enviaron al Laboratorio de Virología del IPK para confirmar la etiología viral. Resultados: Se obtuvo predominio de las infecciones de inicio precoz, así como la localización respiratoria. Se observó una alta incidencia de infecciones virales sobre todo causadas por citomegalovirus.